Here is a list of all functions with links to the files they belong to:

- c -

• c3d_get_atom_coordinates() : read_c3d.c
• calc_bonds() : calc_menu.c
• calc_gr_sq() : calc_menu.c
• calc_msd() : calc_menu.c
• calc_qm_option_box() : cpmd_init.c
• calc_rings() : calc_menu.c
• calc_sph() : calc_menu.c
• calc_window() : calc_menu.c
• calcdij() : utils.F90
• calcrij() : utils.F90
• calculation_time() : global.c, global.h
• camera_has_changed() : m_rep.c
• cancel_but() : datab.c
• cancel_changes() : datab.c
• cancel_win() : datab.c
• cap_indices() : d_bonds.c
• cap_vertices() : d_bonds.c
• cap_volume() : w_volumes.c
• cart2spher() : spherical.F90
• cask() : interface.c, interface.h
• cbox() : global.h, gtk-misc.c
• cell_actions() : datab.c
• cell_data_from_pdb_() : callbacks.c
• cell_get_lattice() : read_npt.c
• cell_tab() : cell_edit.c, cell_super.c
• cell_title() : datab.c
• center_molecule() : atom_edit.h, cell_edit.h, glview.c
• center_this_molecule() : glview.c, glview.h, w_volumes.c
• chains() : chains.F90
• chains_search_steps() : chains.F90
• chains_tab() : w_chains.c, w_coord.c
• chains_to_ogl() : chains_ogl.F90
• chains_to_ogl_menu() : chains_ogl.F90
• change_axis_pos_radio() : m_axis.c
• change_box_axis_radio() : m_box.c
• change_color_map() : glwindow.c
• change_color_radio() : m_map.c
• change_mouse_mode_radio() : m_tools.c
• change_project_name() : workspace.c, workspace.h
• change_render_radio() : m_render.c
• change_rep_radio() : m_rep.c
• change_sel_mode_radio() : m_tools.c
• change_style_radio() : m_style.c
• changed_action_renderer() : w_search.c
• changed_atom_combo() : dlp_edit.c
• changed_basis_pseudo_box() : cp2k_files.c
• changed_calc_box() : cpmd_init.c
• changed_calc_opt_box() : cpmd_init.c
• changed_cp2k_box() : cp2k_init.c
• changed_cp2k_option_box() : cp2k_init.c
• changed_cross_combo() : dlp_edit.c
• changed_dummy_id_box() : cpmd_atoms.c
• changed_energy_unit() : dlp_field.c
• changed_field_key_combo() : dlp_edit.c
• changed_field_key_renderer() : dlp_field.c
• changed_field_prop_combo() : dlp_ff_match.c
• changed_info() : cpmd_init.c
• changed_init_box() : dlp_field.c
• changed_mol_box() : dlp_field.c, dlp_field.h
• changed_nose_thermo_id_box() : cpmd_nose.c
• changed_opt_box() : cpmd_atoms.c, cpmd_init.c
• changed_restart_box() : cpmd_restart.c
• changed_spec_combo() : callbacks.c
• changed_thermo_box() : cpmd_nose.c
• changed_thermo_box_nose() : cpmd_nose.c
• changed_update_renderer() : dlp_ff_match.c
• charint() : utils.F90
• check_all_trees() : atom_edit.h, popup.c, w_search.c
• check_ana() : dlp_control.c
• check_atom_for_updates() : dlp_edit.c, dlp_ff_match.c
• check_button() : global.h, gtk-misc.c
• check_chain() : chains.F90
• check_coord_modification() : atom_edit.h, atom_geo.c
• check_elec() : dlp_control.c
• check_equi() : dlp_control.c
• check_for_species() : read_c3d.c, readers.h, read_hist.c, read_coord.c
• check_for_to_lab() : read_cif.c
• check_hidden_visible() : m_tools.c, popup.c
• check_impact() : dlp_control.c
• check_io() : dlp_control.c
• check_it() : d_poly.c
• check_label_numbers() : glview.h, popup.c, w_search.c
• check_met() : dlp_control.c
• check_motion_interactors() : atom_edit.h, atom_move.c
• check_nvs() : dlp_control.c
• check_opengl_rendering() : main.c
• check_out() : dlp_control.c
• check_read_sa() : callbacks.c
• check_ring() : rings-king.F90
• check_selection() : d_selection.c
• check_semi() : dlp_control.c
• check_sys() : dlp_control.c
• check_tersoffs() : dlp_edit.c, dlp_field.c
• check_this_fprop() : dlp_ff_match.c
• check_this_other_prop() : dlp_copy.c
• check_to_update_shaders() : movie.c
• check_to_visualize_properties() : dlp_field.c, dlp_mol.c, dlp_viz.c
• check_to_visualize_properties_for_this_field_mol() : dlp_edit.c, dlp_viz.c
• check_tree_for_this_search() : w_search.c
• check_triangles() : d_poly.c, d_rings.c
• check_vdw() : dlp_control.c
• check_xml() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• check_xml_string() : w_library.c
• chemistry() : chemistry.F90
• chemistry_() : bind.h
• choose_format() : w_img.c
• choose_set() : cedit.c, tab-2.c
• cif_file_get_atoms_data() : read_cif.c
• cif_file_get_data_in_loop() : read_cif.c
• cif_file_get_number_of_atoms() : read_cif.c
• cif_file_get_number_of_positions() : read_cif.c
• cif_get_atomic_coordinates() : read_cif.c
• cif_get_cell_data() : read_cif.c
• cif_get_space_group() : read_cif.c
• cif_get_symmetry_positions() : read_cif.c
• cif_get_value() : read_cif.c
• clean_all_trees() : atom_edit.h, cbuild_edit.h, atom_action.c
• clean_animation() : w_encode.c
• clean_atom_style() : m_style.c
• clean_atom_win() : atom_edit.c
• clean_chains_data() : global.h, chainscall.c
• clean_coord_window() : bdcall.c, chainscall.c, ringscall.c, atom_edit.c, atom_edit.h, cell_super.c
• clean_coords_and_geoms() : atom_coord.c
• clean_curves_data() : initc.c, curve.h
• clean_dummy_widgets() : cpmd_atoms.c
• clean_field() : dlp_field.c
• clean_field_struct_list() : dlp_field.h, dlp_init.c
• clean_labels() : d_axis.c, d_label.c, d_measures.c
• clean_motion_search() : atom_action.c
• clean_nose_widgets() : cpmd_nose.c
• clean_object_bonds() : atom_object.c
• clean_object_vois() : atom_object.c
• clean_old_atom() : dlp_atom.c
• clean_other_window_after_edit() : atom_edit.c, atom_edit.h
• clean_picked_and_labelled() : w_search.c, atom_edit.h
• clean_rings_data() : global.h, ringscall.c
• clean_sgl_data() : cbuild_sg.c
• clean_thermostat() : cpmd_nose.c
• clean_this_curve_window() : curve.c, initc.c
• clean_this_field_data() : force_fields.c
• clean_this_object() : atom_edit.h, atom_object.c
• clean_this_proj() : cbuild_action.c
• clean_this_project() : atom_action.c
• clean_todo() : atom_edit.h, w_search.c
• clean_up_molecules_info() : dlp_edit.c, dlp_mol.c
• clean_view() : project.h, gui.c
• clean_volumes_data() : global.h, w_volumes.c
• clean_xml_data() : force_fields.c, cbuild_edit.h, w_library.c
• cleaning_shaders() : glview.h, ogl_shading.c
• clear_field_atoms() : dlp_mol.c
• clear_fields() : w_search.c
• cloned_poly() : m_poly.c, w_coord.c
• close_advanced() : w_advance.c
• close_advanced_opengl() : w_advance.c
• close_build() : atom_edit.h, cbuild_edit.c
• close_cell() : cell_edit.c
• close_cell_edit() : cell_edit.c
• close_coord() : w_coord.c
• close_edit() : cbuild_edit.h, atom_edit.c
• close_event_coord() : w_coord.c
• close_event_model() : w_atoms.c
• close_frame_buffer() : image.c, movie.c
• close_measure_event() : w_measures.c
• close_ml() : w_measures.c
• close_model() : w_atoms.c
• close_project() : close_p.c, project.h
• close_the_assistant() : dlp_field.c
• col_surface() : color_box.c, initcoord.c, w_coord.c
• color_atoms_submenu() : m_atoms.c
• color_axis() : d_axis.c
• color_box() : color_box.c, color_box.h
• color_button() : global.h, gtk-misc.c
• color_item() : m_coord.c, submenus.h
• colrgba_togtkrgba() : global.h, gtk-misc.c
• column_actions() : datab.c
• column_title() : datab.c
• combo_cross() : dlp_edit.c
• combo_text_append() : global.h, gtk-misc.c
• combo_text_prepend() : global.h, gtk-misc.c
• combox_rings() : calc_menu.c
• combox_rings_changed() : calc_menu.c
• combox_tunit_changed() : calc_menu.c
• compare_body() : dlp_comp.c
• compare_non_bonded() : dlp_atom.c, dlp_comp.c, dlp_edit.c
• compute_lattice_properties() : cbuild_action.c, read_cif.c
• compute_this_prop() : gui.c, work_menu.c
• confirm_selection() : calc.c, calc.h
• convert_rgb_pixbuf_to_yuv() : movie.c
• convert_to_pixbuf() : global.h, gtk-misc.c
• coord_menu() : atom_edit.h, initcoord.c
• coord_properties() : glwindow.c, w_coord.c, popup.c, m_poly.c, m_coord.c, initcoord.c
• coord_sphere_multiplicity() : dlp_init.c
• coord_tab() : w_coord.c
• coordination_info() : bdcall.c
• coordout_() : bdcall.c
• copy_bond_selection() : popup.c
• copy_content() : datab.c
• copy_light_source() : w_advance.c
• copy_light_sources() : ogl_draw.c, w_advance.c
• copy_row() : datab.c
• copy_the_atoms() : glwindow.c, popup.c
• copy_the_coord() : popup.c
• copy_this_atom() : popup.c
• correct_coordinates_for_object() : atom_object.c
• correct_pos_and_get_dim() : atom_object.c, atom_edit.h
• correct_this_window_title() : workspace.h, workspace.c
• cp2k_file_info() : cp2k_init.c
• cp2k_fix_molecule() : cp2k_init.c, cp2k_mol.c
• cp2k_is_basis_in_database() : cp2k.h, cp2k_files.c
• cp2k_is_pseudo_in_database() : cp2k.h, cp2k_files.c
• cp2k_option_box() : cp2k_init.c
• cp2k_option_dialog() : cp2k_init.c
• cp2k_section_box() : cp2k_init.c
• cp2k_select_coord_id() : cp2k_mol.c, cpmd_nose.c
• cp2k_with_motion() : cp2k_init.c
• cp2kbool() : cp2k_print.c
• cp_section_name() : cp2k_init.c
• cpmd_box() : cp2k_init.c, cpmd.h, cpmd_init.c, cpmd_nose.c, cpmd_restart.c
• cpmd_select_atom_id() : cpmd_nose.c
• cqvf() : cqvf.F90
• cqvf_() : bind.h
• creat_ring() : utils.F90
• create_3d_model() : glwindow.c, w_library.c
• create_about_dialog() : interface.c, interface.h
• create_action_combo() : atom_search.c, cbuild_edit.h
• create_add_remove_section() : m_curve.c
• create_analyze_box() : dlp_control.c
• create_analyze_menu() : gui.c
• create_atom() : glview.h
• create_atom_lists() : d_atoms.c, d_selection.c, ogl_draw.c
• create_atom_notebook() : atom_edit.c, atom_edit.h
• create_atoms_tree() : cbuild_edit.h, w_search.c
• create_axis_entries() : atom_move.c
• create_axis_lists() : d_axis.c, ogl_draw.c
• create_axis_matrices() : d_axis.c, glview.h
• create_bl_combo() : cbuild_edit.c
• create_bond() : glview.h
• create_bond_layout_section() : m_bonds.c
• create_bond_lists() : d_bonds.c, d_selection.c, ogl_draw.c
• create_box_lists() : d_box.c, ogl_draw.c
• create_button() : global.h, gtk-misc.c
• create_cell_edition_window() : atom_edit.h, cell_edit.c
• create_cell_entries() : cell_edit.h, cell_shift.c
• create_cell_notebook() : cell_edit.c
• create_chains_search() : w_chains.c
• create_chains_tree() : w_chains.c
• create_classical_force_field() : calc.c, dlp_field.c
• create_combo() : global.h, gtk-misc.c
• create_combo_mol() : dlp_field.c, dlp_field.h
• create_cp2k_spec_box() : cp2k_init.c
• create_css_button() : w_periodic.c
• create_css_color_bar() : m_map.c
• create_css_group() : w_periodic.c
• create_curve() : w_curve.c, tools.c
• create_curve_menu() : m_curve.c
• create_curve_submenu() : m_curve.c
• create_data_menu() : m_curve.c
• create_dummy_box() : cpmd_atoms.c
• create_dummy_param_box() : cpmd_atoms.c, cpmd_nose.c
• create_dump_box() : dlp_control.c
• create_edit_menu() : gui.c
• create_edition_window() : atom_edit.c
• create_el_preview() : w_periodic.c
• create_elec_param_box() : dlp_control.c
• create_electro_box() : dlp_control.c
• create_ensemble_box() : dlp_control.c
• create_entry() : global.h, gtk-misc.c
• create_equi_box() : dlp_control.c
• create_expander() : global.h, gtk-misc.c
• create_ff_structure() : dlp_field.c
• create_field() : calc.c, m_tools.c
• create_field_list() : dlp_field.c
• create_field_prop_combo() : dlp_ff_match.c, dlp_edit.c
• create_field_tree() : dlp_field.c, dlp_field.h
• create_file_chooser() : global.h, gtk-misc.c
• create_force_field_data_structure() : dlp_field.h, dlp_init.c
• create_frag_mol_search() : w_coord.c
• create_frag_mol_tree() : w_coord.c
• create_gmenu_item() : gui.c
• create_hbox() : global.h, gtk-misc.c
• create_help_menu() : gui.c
• create_hscale() : global.h, gtk-misc.c
• create_image_from_data() : global.h, gtk-misc.c
• create_io_box() : dlp_control.c
• create_job_box() : dlp_control.c
• create_label_lists() : d_label.c, ogl_draw.c
• create_label_matrices() : d_label.c, glview.h
• create_layout() : global.h, gtk-misc.c
• create_layout_widget() : m_axis.c
• create_light_lists() : d_box.c, ogl_draw.c
• create_lights_combo() : w_advance.c
• create_main_window() : gui.c, main.c
• create_map_buttons() : m_map.c
• create_map_tree() : m_map.c
• create_md_box() : dlp_control.c
• create_measure_label() : w_measures.c
• create_measures_lists() : ogl_draw.c, d_measures.c
• create_menu_item() : global.h
• create_menu_item_from_widget() : global.h
• create_metal_box() : dlp_control.c
• create_misc_box() : dlp_control.c
• create_mol_box() : dlp_field.c
• create_movie() : movie.c
• create_new_project_using_data() : calc.c, popup.c
• create_nose_box() : cpmd_nose.c
• create_nose_thermo_param_box() : cpmd_nose.c
• create_object_from_atom_coordination() : atom_edit.h, atom_object.c
• create_object_from_frag_mol() : atom_edit.h, atom_object.c, glview.c
• create_object_from_library() : atom_edit.h, atom_object.c, w_library.c
• create_object_from_open_project() : atom_edit.h, atom_object.c
• create_object_from_overall_coordination() : atom_edit.h, atom_object.c
• create_object_from_selection() : atom_edit.h, atom_object.c
• create_object_from_species() : atom_edit.h, atom_object.c
• create_opengl_window() : startup_testing.c
• create_org_list() : cedit.c, tab-2.c
• create_out_box() : dlp_control.c
• create_overall_box() : dlp_control.c
• create_pick_lists() : d_selection.c, ogl_draw.c
• create_poly_lists() : ogl_draw.c, d_poly.c
• create_projects_tree() : cedit.c
• create_qm_input_file() : calc.c, cpmd_init.c
• create_restart_box() : dlp_control.c
• create_ring_lists() : d_rings.c, ogl_draw.c
• create_rings_search() : w_rings.c
• create_rings_tree() : w_rings.c
• create_scroll() : global.h, gtk-misc.c
• create_search_box() : atom_search.c
• create_selection_button() : cp2k_init.c, cpmd_atoms.c, cpmd_nose.c
• create_selection_combo() : cpmd_nose.c, cpmd_atoms.c, cpmd_init.c
• create_selection_item() : popup.c
• create_selection_lists() : d_selection.c, ogl_draw.c
• create_selection_tree() : w_measures.c
• create_setting_info() : cbuild_info.c
• create_setting_pos() : w_advance.c
• create_shader() : ogl_shading.c
• create_shift_box() : cell_edit.h, cell_shift.c
• create_slab_info() : d_box.c, cell_cut.c
• create_slab_lists() : d_box.c, cell_edit.h, ogl_draw.c, w_search.c
• create_slab_param_combo() : cell_cut.c
• create_splash_window() : main.c
• create_string_texture() : ogl_text.c
• create_sys_box() : dlp_control.c
• create_tab_1() : cedit.c, tab-1.c
• create_tab_2() : cedit.c, tab-2.c
• create_tab_3() : cedit.c, tab-3.c
• create_tab_4() : cedit.c, tab-4.c
• create_text_view() : global.h, gtk-misc.c
• create_thermo_box() : dlp_control.c
• create_thermo_options() : dlp_control.c
• create_traj_box() : dlp_control.c
• create_update_tree() : dlp_ff_match.c
• create_vbox() : gtk-misc.c, global.h
• create_vdw_box() : cp2k_init.c
• create_vdws_box() : dlp_control.c
• create_volumes_lists() : d_box.c, ogl_draw.c
• create_vscale() : global.h, gtk-misc.c
• create_win() : global.h, gtk-misc.c
• create_workspace() : workspace.c
• create_workspace_menu() : gui.c, work_menu.c
• create_workspace_tree() : workspace.c
• create_wyck_pts_info() : cbuild_info.c
• create_wyckoff_tree() : cbuild_info.c
• crystal_window() : m_edit.c, cbuild_edit.c
• css_element() : w_periodic.c
• cuboid_slab() : d_box.c
• curve_add_remove_menu_action() : m_curve.c
• curve_button_event() : w_curve.c
• curve_close_section() : m_curve.c
• curve_default_layout() : cwidget.c, m_curve.c
• curve_default_scale() : cwidget.c
• curve_edit_menu_action() : m_curve.c
• curve_help_menu() : m_curve.c
• curve_key_pressed() : w_curve.c
• curve_menu_bar() : m_curve.c
• curve_menu_bar_action() : m_curve.c, w_curve.c
• curve_popup_menu() : curve.h, m_curve.c
• curve_section() : m_curve.c
• curve_window_add_menu_bar() : m_curve.c, curve.h
• curve_zoom_in_out() : w_curve.c
• curvetbox() : gui.c, tools.c
• custom_mize_map() : m_map.c
• cut_box() : edit_menu.c, w_cutoffs.c
• cut_in_model() : cell_cut.c, cell_edit.h
• cut_this_slab() : cell_cut.c
• cutfit() : gr.F90
• cutoffsend() : global.h, bdcall.c
• cylinder_indices() : d_bonds.c
• cylinder_slab() : d_box.c
• cylinder_vertices() : d_bonds.c