Here is a list of all functions with links to the files they belong to:

- s -

• s_of_k() : sk.F90
• s_of_k_() : bind.h
• s_of_q() : sq.F90
• s_of_q_() : bind.h
• sacos() : utils.F90
• same_coords() : cbuild_action.c
• save_all_selections() : selection.c, glview.h
• save_angle_selection() : selection.c
• save_atom_a() : project.h, save_opengl.c
• save_atom_b() : save_opengl.c
• save_atom_m() : save_mol.c
• save_bond_selection() : selection.c
• save_bonding() : project.h, save_bond.c
• save_chains_data_() : chainscall.c
• save_color_map() : bdcall.c, project.h
• save_coordinates() : atom_edit.h, atom_move.c
• save_cp2k_data() : project.h, save_qm.c
• save_cpmd_data() : project.h, save_qm.c
• save_curve_() : curve.c
• save_dihedral_selection() : selection.c
• save_dijkstra_ring() : rings-primitive.F90
• save_dlp_field_data() : save_field.c, project.h
• save_field_atom() : save_field.c
• save_field_body() : save_field.c
• save_field_constraint() : save_field.c
• save_field_external() : save_field.c
• save_field_molecule() : save_field.c
• save_field_pmf() : save_field.c
• save_field_prop() : save_field.c
• save_field_rigid() : save_field.c
• save_field_shell() : save_field.c
• save_field_struct() : save_field.c
• save_field_tethered() : save_field.c
• save_fixed_atoms() : save_qm.c
• save_image() : curve.h, w_img.c
• save_lmp_field_data() : project.h, save_field.c
• save_mol() : project.h, save_mol.c
• save_movie() : movie.c, movie.h
• save_opengl_image() : project.h, save_opengl.c
• save_pos_() : project.c
• save_project() : project.h, save_p.c
• save_project_curve() : project.h, save_curve.c
• save_rings_chains_data() : save_opengl.c
• save_rings_data_() : ringscall.c
• save_rotation_quaternion() : atom_edit.h, glview.c, glwindow.c, m_rep.c, w_spiner.c
• save_row() : datab.c
• save_thermo() : save_qm.c
• save_this_chain() : chains.F90
• save_this_mol() : save_mol.c
• save_this_ring() : rings-king.F90
• save_this_string() : project.h, save_p.c
• save_to_file() : writedata.F90
• save_to_file_() : w_data.c
• save_xsk_() : sqcall.c
• scale() : curve.c, curve.h
• scale_param() : w_advance.c
• scale_quality() : w_advance.c
• scroll_range_move() : atom_edit.h, atom_move.c
• scroll_scale_param() : w_advance.c
• scroll_scale_quality() : w_advance.c
• scroll_set_axis_position() : w_axis.c
• scroll_set_camera() : m_rep.c
• scroll_set_fog_param() : w_advance.c
• scroll_set_label_shift() : w_labels.c
• scroll_set_measure_factor() : w_labels.c
• scroll_set_measure_width() : w_labels.c
• scroll_set_poly_alpha() : w_coord.c
• scroll_set_slab_alpha() : cell_cut.c
• scroll_set_ticks_angle() : tab-4.c
• scroll_shift_coord() : cell_shift.c
• search_for_new_spec() : atom_edit.h, atom_species.c
• search_set_visible() : w_search.c
• search_strong_rings() : rings-primitive.F90
• section_box() : cpmd_init.c
• section_name() : cpmd_init.c
• select_action_for_all() : popup.c
• select_action_for_all_bonds() : popup.c
• select_action_for_this_bond() : popup.c
• select_all_atoms() : w_search.c
• select_atom() : w_search.c
• select_atom_from_model() : cpmd_nose.c
• select_atom_id_from_fied_molecule() : dlp_edit.c, dlp_field.h
• select_atom_set_cmv() : dlp_edit.c
• select_atom_set_color() : dlp_edit.c
• select_atoms_not_thermostated() : cpmd_nose.c
• select_dummy() : cpmd_atoms.c
• select_field_action() : dlp_field.c
• select_field_atom() : dlp_atom.c
• select_fixed_atom_confirm() : cp2k_mol.c
• select_frag() : cp2k_mol.c
• select_from_library() : w_library.c, w_search.c
• select_input_type() : cp2k_init.c
• select_it() : dlp_edit.c
• select_library_data() : w_library.c
• select_mol() : dlp_mol.c
• select_object() : dlp_edit.c, dlp_viz.c
• select_row() : datab.c
• select_thermo() : cpmd_nose.c
• select_this_slab() : cell_cut.c
• select_unselect_atoms() : popup.c, glwindow.c, global.h
• select_unselect_coord() : global.h, popup.c
• select_unselect_this_atom() : global.h, popup.c
• selectdash() : curve.c, curve.h
• selection_button() : dlp_edit.c
• selection_menu() : popup.c
• selection_mode_menu() : m_tools.c
• selection_tab() : w_atoms.c, w_search.c, atom_edit.h
• send_atom_chains_id_opengl_() : initchain.c
• send_atom_rings_id_opengl_() : initring.c
• send_chains_opengl_() : initchain.c
• send_chem_info_() : interface.c
• send_coord_opengl_() : initcoord.c, initcoord.h
• send_gr() : sq.F90
• send_gr_() : bind.h
• send_label() : xyz.F90
• send_label_() : bind.h
• send_mol_details_() : initmol.c
• send_mol_neighbors_() : initmol.c
• send_pos() : prepdata.F90
• send_rings_opengl_() : initring.c
• send_sq() : grfft.F90
• send_sq_() : bind.h
• send_steps_() : project.c
• sendcutoffs_() : grcall.c
• sendcuts() : bonds.F90
• sendcuts_() : bind.h
• sens_superbut() : cell_edit.h, cell_super.c
• seq_faster() : w_sequencer.c
• seq_go_first() : w_sequencer.c
• seq_go_last() : w_sequencer.c
• seq_go_next() : w_sequencer.c
• seq_go_previous() : w_sequencer.c
• seq_go_to() : w_sequencer.c
• seq_jump() : w_sequencer.c
• seq_loop() : w_sequencer.c
• seq_play() : w_sequencer.c
• seq_slower() : w_sequencer.c
• seq_stop() : w_sequencer.c
• sequence() : w_sequencer.c
• set_advanced_bonding_menus() : initcoord.h
• set_advanced_sq() : calc_menu.c
• set_ana_param() : dlp_control.c
• set_angular_precision() : w_volumes.c
• set_at_color() : color_box.c
• set_atom() : w_search.c
• set_atom_color() : w_atoms.c
• set_atom_color_map_box() : w_coord.c
• set_atom_id() : dlp_init.c
• set_atom_parameter() : m_atoms.c, w_atoms.c
• set_atoms_for_action() : atom_search.c
• set_atoms_to_insert() : atom_edit.h, atom_insert.c
• set_autoscale() : tab-4.c
• set_axis() : tab-4.c
• set_axis_color() : w_axis.c
• set_axis_combo_style() : w_axis.c
• set_axis_for_motion() : atom_move.c
• set_axis_labels() : w_axis.c
• set_axis_legend() : tab-4.c
• set_axis_max() : tab-4.c
• set_axis_min() : tab-4.c
• set_axis_position() : w_axis.c
• set_axis_template() : w_axis.c
• set_axis_title() : w_axis.c
• set_axis_title_font() : tab-4.c
• set_axis_title_x_spin() : tab-4.c
• set_axis_title_y_spin() : tab-4.c
• set_back_color() : color_box.c
• set_background() : w_img.c
• set_background_color() : tab-1.c
• set_bl() : cbuild_edit.c
• set_bond_parameter() : m_bonds.c, w_bonds.c
• set_box_axis_style() : glwindow.c
• set_box_color() : color_box.c
• set_box_combo_style() : w_box.c
• set_bshift() : tab-2.c
• set_camera() : m_rep.c
• set_camera_pos() : m_proj.c
• set_camera_spin() : m_rep.c
• set_cif_to_insert() : read_cif.c
• set_color_box() : w_box.c
• set_color_chooser_color() : global.h, gtk-misc.c
• set_color_coord() : w_coord.c
• set_color_frag_mol() : w_coord.c
• set_color_map() : bdcall.c, glwindow.c, m_map.c, w_coord.c, project.h
• set_color_map_sensitive() : glwindow.c, open_p.c
• set_cs() : cbuild_edit.c
• set_curve_data_zero() : curve.c
• set_cut() : w_cutoffs.c
• set_data() : force_fields.c
• set_data_aspect() : cedit.c, tab-2.c
• set_data_color() : tab-2.c
• set_data_dash() : tab-2.c
• set_data_glyph() : tab-2.c
• set_data_glyph_freq() : tab-2.c
• set_data_glyph_size() : tab-2.c
• set_data_hist_opac() : tab-2.c
• set_data_hist_pos() : tab-2.c
• set_data_hist_width() : tab-2.c
• set_data_pos() : w_advance.c
• set_data_style() : tab-1.c, tab-2.c
• set_data_thickness() : tab-2.c
• set_default_color() : glview.c, glview.h
• set_delta() : calc_menu.c
• set_elec_eval() : dlp_control.c
• set_elec_param() : dlp_control.c
• set_encoding_widget_sensitivity() : w_encode.c
• set_ensemble() : dlp_control.c
• set_equi_combo() : dlp_control.c
• set_equi_param() : dlp_control.c
• set_field_atom_name() : dlp_init.c, dlp_mol.c
• set_field_label() : dlp_field.c
• set_filter_changed() : bdcall.c, atom_edit.h, cell_cut.c, w_search.c
• set_fog_mode() : w_advance.c
• set_fog_param() : w_advance.c
• set_fog_type() : w_advance.c
• set_frag_mol_cell_background() : w_coord.c
• set_frag_mol_color() : color_box.c
• set_frame_color() : tab-1.c
• set_frame_line() : tab-1.c
• set_frame_pos() : tab-1.c
• set_frame_style() : tab-1.c
• set_frame_thickness() : tab-1.c
• set_frame_type() : tab-1.c
• set_full_screen() : glwindow.c, m_rep.c, popup.c
• set_going_forward() : cpmd_nose.c
• set_grid() : tab-4.c
• set_i_coord() : w_search.c
• set_id() : w_search.c
• set_image_format() : w_encode.c
• set_image_from_icon_name() : global.h, gtk-misc.c
• set_img_lights() : cbuild_edit.h, glview.c
• set_io_method() : dlp_control.c
• set_io_param() : dlp_control.c
• set_io_ticks() : tab-4.c
• set_l_model() : w_advance.c
• set_lab_digit_spin() : tab-4.c
• set_lab_shift_x_spin() : tab-4.c
• set_lab_shift_y_spin() : tab-4.c
• set_label_color() : w_labels.c
• set_label_shift() : w_labels.c
• set_labels_font() : w_axis.c, w_labels.c
• set_labels_format() : w_labels.c
• set_labels_position() : w_labels.c
• set_labels_render() : w_axis.c, w_labels.c
• set_labels_scale() : w_labels.c, w_axis.c
• set_labels_tilt() : w_labels.c
• set_lattice() : cbuild_edit.c
• set_legend_box_color() : tab-3.c
• set_legend_box_line() : tab-3.c
• set_legend_box_style() : tab-3.c
• set_legend_box_thickness() : tab-3.c
• set_legend_color() : tab-3.c
• set_legend_font() : tab-3.c
• set_legend_pos() : tab-3.c
• set_library_markup() : w_library.c
• set_light_fix() : w_advance.c
• set_light_type() : w_advance.c
• set_light_uniform_location() : ogl_shading.c
• set_lights_data() : ogl_shading.c
• set_mass() : prepdata.F90
• set_mass_() : bind.h
• set_max() : calc_menu.c
• set_max_action() : w_search.c
• set_max_div() : tab-4.c
• set_max_msd() : w_search.c
• set_max_msd_for_all() : w_search.c
• set_md_combo() : dlp_control.c
• set_md_param() : dlp_control.c
• set_md_step_vol() : w_volumes.c
• set_measure_color() : d_measures.c
• set_measure_factor() : w_labels.c
• set_measure_style() : w_labels.c
• set_measure_width() : w_labels.c
• set_min_div_spin() : tab-4.c
• set_mode() : work_menu.c, m_tools.c, glwindow.c, atom_edit.h, cbuild_edit.h
• set_mol_data_list() : atom_remove.c
• set_mol_num_label() : dlp_field.c, dlp_field.h
• set_motion() : glwindow.c
• set_motion_sensitive() : m_tools.c
• set_move() : atom_edit.h, atom_move.c
• set_nbd_but_sensitive() : dlp_field.c
• set_neutron() : prepdata.F90
• set_neutron_() : bind.h
• set_nlights() : w_advance.c
• set_nlights_spin() : w_advance.c
• set_numa() : calc_menu.c
• set_object_changed() : atom_edit.h, w_search.c
• set_object_pos() : w_advance.c
• set_occupancy() : w_search.c
• set_old_cmap() : movie.c
• set_order() : dlp_control.c
• set_out_param() : dlp_control.c
• set_partial_coord_color() : color_box.c
• set_player_title() : w_sequencer.c
• set_point_color() : m_map.c
• set_point_position() : m_map.c
• set_poly_alpha() : w_coord.c
• set_poly_color_map_box() : w_coord.c
• set_pos_labels() : tab-4.c
• set_pos_ticks() : tab-4.c
• set_print_level() : dlp_control.c
• set_quality() : m_quality.c, w_advance.c
• set_quality_spin() : m_quality.c
• set_radius() : prepdata.F90
• set_radius_() : bind.h
• set_render() : glwindow.c, m_render.c
• set_renderer_color() : global.h, gtk-misc.c
• set_rep() : m_rep.c
• set_rescaling() : cell_density.c
• set_reset_transformation() : atom_edit.c, atom_edit.h
• set_rings_color() : color_box.c
• set_scale() : tab-4.c
• set_search_digit() : w_search.c
• set_search_mode() : atom_edit.h, w_search.c
• set_selection_mode() : glwindow.c, m_tools.c
• set_sensitive_atom() : dlp_atom.c
• set_sensitive_coord_menu() : glwindow.c
• set_sensitive_mol() : dlp_mol.c
• set_set() : cedit.c
• set_sfact() : calc_menu.c
• set_sg() : cbuild_edit.c
• set_shc() : cbuild_edit.c
• set_shift() : dmtx.F90, cell_shift.c
• set_show_axis_toggle() : atom_edit.h, w_axis.c
• set_show_box_toggle() : w_box.c
• set_show_frame() : tab-1.c
• set_show_motion_axis() : atom_move.c
• set_size() : w_img.c
• set_slab_alpha() : cell_cut.c
• set_slab_option() : cell_cut.c
• set_slab_property() : cell_cut.c
• set_slab_type() : cell_cut.c
• set_so() : cbuild_edit.c
• set_so_info() : cbuild_info.c
• set_spec_changed() : atom_edit.h, w_search.c
• set_style() : glwindow.c, m_style.c
• set_sys_param() : dlp_control.c
• set_sys_restart() : dlp_control.c
• set_template() : w_advance.c
• set_thermo_param() : dlp_control.c
• set_thermostat() : dlp_control.c
• set_this_frag_mol_color() : w_coord.c
• set_ticks_angle() : tab-4.c
• set_ticks_labels_font() : tab-4.c
• set_ticks_size_major_spin() : tab-4.c
• set_ticks_size_minor_spin() : tab-4.c
• set_title() : tab-1.c
• set_title_color() : tab-1.c
• set_title_custom() : tab-1.c
• set_title_default() : tab-1.c
• set_title_font() : tab-1.c
• set_title_pos() : tab-1.c
• set_total_coord_color() : color_box.c
• set_use_template_toggle() : w_advance.c
• set_v_dummy() : read_coord.c, readers.h
• set_vdw_mix() : dlp_control.c
• set_vdw_param() : dlp_control.c
• set_video_bitrate() : w_encode.c
• set_video_codec() : w_encode.c
• set_video_extra_frames() : w_encode.c
• set_video_frames() : w_encode.c
• set_video_opengl_spin() : w_encode.c
• set_video_res() : w_encode.c
• set_visible_curve_data() : cedit.c
• set_volume_color() : w_volumes.c
• set_window_size() : tab-1.c
• set_wisible() : cbuild_info.c
• set_wr() : cbuild_edit.c
• setbox() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• setchemistry() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• setcutoffs() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• setmol() : molecules.F90
• setpbc() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• setprop() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• settime() : read_isaacs.h, read_isaacs.c
• setup_all_cylinder_vertices() : d_bonds.c
• setup_all_selected_bond_vertices() : d_selection.c
• setup_arrow() : d_axis.c
• setup_atom_vertices() : d_atoms.c
• setup_atomic_weight() : dlp_init.c
• setup_bonds() : glview.h
• setup_box_vertices() : d_box.c
• setup_camera() : ogl_draw.c
• setup_cap_vertice() : d_box.c, d_bonds.c, d_axis.c
• setup_clone_vertices() : d_atoms.c
• setup_cpat_vpat() : rings-king.F90
• setup_cpat_vpat_chain() : chains.F90
• setup_cpat_vpat_ring() : rings-king.F90
• setup_cs_labels() : dlp_field.c
• setup_custom_color_map() : m_map.c, project.h
• setup_cylinder_vertice() : d_selection.c, d_box.c, d_axis.c, d_bonds.c
• setup_extra_box_vertices() : d_box.c
• setup_field_molecule_neighbors() : dlp_field.h
• setup_fog_dialogs() : w_advance.c
• setup_fragments_() : initmol.c
• setup_line_vertice() : d_selection.c, d_measures.c, d_box.c, d_bonds.c, d_axis.c
• setup_line_vertices() : d_bonds.c
• setup_menu_molecules_() : initmol.c
• setup_molecules() : initcoord.c
• setup_molecules_() : initmol.c
• setup_passivate() : cell_cut.c
• setup_polyhedron() : d_poly.c, d_rings.c
• setup_selected_clone_vertices() : d_selection.c
• setup_sphere_vertice() : d_atoms.c, d_selection.c, d_axis.c, d_box.c
• setup_summit() : d_poly.c
• setup_tetra() : d_poly.c
• setup_tetrahedron() : d_rings.c, d_poly.c
• setup_text_tags() : gtk-misc.c
• setup_this_atom() : d_atoms.c, d_selection.c
• setup_this_bond() : d_bonds.c, d_selection.c
• setup_this_force_field() : dlp_field.h, force_fields.c
• setup_this_measured_angle() : d_measures.c
• setup_this_measured_bond() : d_measures.c
• setup_triangles() : d_axis.c, d_poly.c, d_selection.c
• setup_xaxis_linear() : curve.h, xaxis.c
• setup_xaxis_log() : curve.h, xaxis.c
• setup_yaxis_linear() : yaxis.c, curve.h
• setup_yaxis_log() : curve.h, yaxis.c
• setview() : datab.c
• sg_combo_tree() : cbuild_edit.c
• sg_info() : cbuild_edit.c
• shading_glsl_text() : ogl_shading.c
• shell_in_vdw() : dlp_edit.c
• shift_box_center() : lattice.F90
• shift_box_center_() : bind.h
• shift_center_tab() : cell_edit.h, cell_shift.c
• shift_coord() : cell_shift.c
• shift_has_changed() : cell_shift.c
• shift_it() : cbuild_edit.h, cell_edit.h, cell_shift.c
• shortcut_ring() : rings-primitive.F90
• shortcuts_window() : glwindow.c, gui.c, m_curve.c
• show_active_light_data() : w_advance.c
• show_advance_time_step() : dlp_control.c
• show_atoms_submenu() : m_atoms.c
• show_curve() : curve.h, show.c
• show_curve_popup_menu() : curve.h
• show_data_legend() : tab-3.c
• show_data_legend_box() : tab-3.c
• show_error() : interface.c, interface.h
• show_error_() : interface.c, interface.h
• show_field_object() : dlp_field.h, dlp_viz.c
• show_force_field_preview() : dlp_field.c
• show_frame() : curve.h, frame.c
• show_Help() : callbacks.h
• show_hide_all_atom_labels() : m_atoms.c
• show_hide_atoms() : m_atoms.c, global.h
• show_hide_box_axis() : m_box.c
• show_hide_clones() : glview.h, m_clones.c
• show_hide_coord() : global.h, m_coord.c
• show_hide_labels() : global.h, m_atoms.c
• show_hide_others() : popup.c
• show_hide_poly() : global.h, ringscall.c, m_poly.c
• show_hide_the_atoms() : popup.c
• show_hide_the_coord() : global.h, popup.c
• show_hide_this_atom() : global.h, popup.c
• show_impact_dialog() : dlp_control.c
• show_info() : interface.h, interface.c
• show_info_() : interface.h
• show_legend() : curve.h, legend.c
• show_light_param() : w_advance.c
• show_periodic_table() : gui.c
• show_pop() : interface.c, interface.h
• show_qm_file_preview() : cpmd_init.c
• show_sg_info() : cbuild_edit.c, cbuild_info.c
• show_the_widgets() : gtk-misc.c, startup_testing.c, global.h
• show_this_light() : w_advance.c
• show_title() : curve.h, title.c
• show_volumes() : w_volumes.c
• show_warning() : interface.c, interface.h
• show_warning_() : interface.c, interface.h
• show_web() : interface.c
• slab_alpha_has_changed() : cell_cut.c
• sml_preview() : w_library.c
• smooth() : utils.F90
• smooth_and_save() : sk.F90
• smooth_and_save_() : bind.h
• so_combo_tree() : cbuild_edit.c, cbuild_info.c
• somme() : utils.F90
• sort() : glview.c, glview.h, read_cif.c
• sort3() : utils.F90
• sort3_dp() : utils.F90
• sort_files() : w_library.c
• sort_partial_geo() : atom_geo.c
• spath_rec() : rings-primitive.F90
• spec_data_() : interface.c
• sphere_indices() : d_atoms.c
• sphere_vertices() : d_atoms.c
• sphere_volume() : w_volumes.c
• spherical_slab() : d_box.c
• sphericals() : spherical.F90
• sphericals_() : bind.h
• spin() : glwindow.c, m_tools.c, w_encode.c, w_spiner.c
• spin_button() : gtk-misc.c, global.h
• spin_go() : glwindow.c, w_spiner.c
• spin_stop() : glwindow.c, w_spiner.c
• stock_image() : global.h, gtk-misc.c
• strfind() : read_isaacs.c, read_isaacs.h
• string_to_double() : global.c, global.h
• strong_rings() : rings-primitive.F90
• struct_id() : dlp_field.c, dlp_field.h
• style_the_atoms() : popup.c
• style_the_coord() : popup.c
• style_this_atom() : popup.c
• substitute_string() : tools.c, modelinfo.c, w_library.c, cbuild_edit.h, interface.c, callbacks.c
• super_cell() : cell_edit.h, cell_super.c
• super_cell_but() : cell_edit.h, cell_super.c
• super_celling() : cell_super.c
• supercell_tab() : cell_edit.h